Khambiyev sirvió bajo la administración del líder separatista Aslan Maskhadov, que fue elegido presidente de Chechenia en 1997.
Maskhadov optó por esconderse después de que los soldados rusos regresaron a Chechenia en 1999, y los enfrentamientos continuaron entre Rusia y los separatistas, hasta que en 1996 Rusia y los líderes chechenos llegaron a un acuerdo para detener la guerra, después de menos de dos años de combates.